Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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