Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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