Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PWP1Q13610 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PWP1Q13610 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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PWP1Q13610 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PWP1Q13610 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PWP1Q13610 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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