Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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