Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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CALCOCO2Q13137 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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