Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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