Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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