Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms