Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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