Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms