Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SREBF2Q12772 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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