Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms