Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms