Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC068594.2-201ENST00000584075 597 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TRIM64DP-201ENST00000529289 1342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC090159.1-201ENST00000525309 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms