Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms