Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms