Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms