Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms