Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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