Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPAP53621 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms