Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAGEA3P43357 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms