Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPD2P43304 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPD2P43304 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms