Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms