Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms