Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms