Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms