Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSFA2P28290 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms