Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTPRDP23468 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRDP23468 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRDP23468 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRDP23468 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRDP23468 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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