Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT1P21579 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT1P21579 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT1P21579 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT1P21579 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms