Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms