Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms