Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms