Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEBPBP17676 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms