Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT13P13646 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT13P13646 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT13P13646 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT13P13646 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT13P13646 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT13P13646 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT13P13646 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT13P13646 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT13P13646 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT13P13646 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT13P13646 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT13P13646 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT13P13646 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT13P13646 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT13P13646 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT13P13646 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT13P13646 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT13P13646 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT13P13646 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT13P13646 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT13P13646 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms