Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSF2P04141 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms