Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms