Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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