Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms