Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms