Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms