Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms