Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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