Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms