Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FANCFQ9NPI8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FANCFQ9NPI8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FANCFQ9NPI8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FANCFQ9NPI8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FANCFQ9NPI8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FANCFQ9NPI8 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FANCFQ9NPI8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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