Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms