Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM8Q9BZR9 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms