Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC46A2Q9BY10 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC46A2Q9BY10 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC46A2Q9BY10 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC46A2Q9BY10 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC46A2Q9BY10 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC46A2Q9BY10 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC46A2Q9BY10 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms