Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HINFPQ9BQA5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HINFPQ9BQA5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms