Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms