Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRAMD1AQ96CP6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms